產(chǎn)品中心

RT-Exo RNA恒溫快速擴(kuò)增試劑盒(熒光型)

包裝規(guī)格：

RNA擴(kuò)增，熒光檢測(cè)

一. 原理概述：
本試劑盒基于一種常溫恒溫核酸快速擴(kuò)增技術(shù)：在常溫恒溫下，特殊修飾的反轉(zhuǎn)錄酶利用特異性引物DNA和模板RNA合成cDNA鏈，反應(yīng)體系中的重組酶、單鏈DNA結(jié)合蛋白和DNA聚合酶以新合成的cDNA鏈為模板進(jìn)行快速核酸擴(kuò)增反應(yīng)。本試劑盒在42 oC下，依賴核酸外切酶的作用，加入根據(jù)模版設(shè)計(jì)的特異的分子探針，使用熒光監(jiān)測(cè)設(shè)備能實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)片段擴(kuò)增過程的實(shí)時(shí)監(jiān)控。適用于實(shí)驗(yàn)室級(jí)別的RNA擴(kuò)增以及其他檢測(cè)用途的RNA擴(kuò)增使用。

二. 產(chǎn)品特點(diǎn)：
本試劑盒具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、反應(yīng)時(shí)間短（僅需20 mins）等優(yōu)點(diǎn)，反應(yīng)組分為干粉狀態(tài)，操作簡(jiǎn)便，易于保存。
可適用于各種品牌的熒光定量PCR儀，恒溫?zé)晒鈹U(kuò)增儀器等熒光檢測(cè)設(shè)備。

三. 引物設(shè)計(jì)：
1. 建議使用長(zhǎng)度在30-35 bp的引物，引物過短會(huì)影響擴(kuò)增速度和檢測(cè)靈敏度；
2. 堿基排布隨機(jī)性高，GC 含量在 30%-70%之間；
3. 引物設(shè)計(jì)避免形成二級(jí)結(jié)構(gòu)而影響擴(kuò)增；
4. 擴(kuò)增子長(zhǎng)度建議在150-300 bp，通常不超過500 bp。

四. 熒光探針設(shè)計(jì)：
在上下游引物中間，設(shè)計(jì)一段長(zhǎng)度為 46-52nt 與目的片段互補(bǔ)的序列作為熒光探針；
探針序列不與特異性引物識(shí)別位點(diǎn)重疊，長(zhǎng)度為46-52 nt，序列避免回文序列、內(nèi)部二級(jí)結(jié)構(gòu)和連續(xù)的重復(fù)堿基。

探針共有四個(gè)修飾位點(diǎn)：
1. 距離 5’端的 30-35 nt 的中部位置標(biāo)記一個(gè) dSpacer（四氫呋喃，THF），作為核酸外切酶的識(shí)別位點(diǎn)（任何堿基，無特殊要求）；
2. THF 位點(diǎn)的上游的 T 堿基上標(biāo)記一個(gè)熒光基團(tuán)（如 FAM），下游在 T 堿基上標(biāo)記一個(gè)淬滅基團(tuán)（如BHQ1），兩個(gè)基團(tuán)的間距為 2-4 nt；
3. THF 距離 3’末端約 15 nt，并且 3’末端標(biāo)記一個(gè)修飾基團(tuán)，例如胺基、磷酸基團(tuán)或 C3-spacer。

五. 試劑盒儲(chǔ)存：
運(yùn)輸條件：低溫運(yùn)輸；
儲(chǔ)存條件：儲(chǔ)存溫度 ≤ -20 oC，避光保存，避免重壓、反復(fù)凍融；
產(chǎn)品有效期：12個(gè)月。 

六. 操作步驟：

提前30分鐘將試劑盒所需組分取出，室溫融化，震蕩混勻。

1).每個(gè)干粉反應(yīng)管加入32.9 μL A buffer（注意：A buffer需完全融化混勻，否則會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)效果產(chǎn)生影響）；

2).每個(gè)反應(yīng)管分別加入2 μL上游引物、2 μL下游引物和0.6 μL探針（引物和探針濃度為10 μM，對(duì)于多個(gè)反應(yīng)、步驟1和步驟2可以混合后再分裝至反應(yīng)管中）；

3).向反應(yīng)管中依次加入7 μL ddH2O和3 μL核酸RNA模板（可根據(jù)核酸濃度調(diào)整加入的核酸模板體積，并相應(yīng)調(diào)整加入的ddH2O體積，至模板與ddH2O總體積為10 μL）；

4).最后向反應(yīng)管中加入2.5 μL B Buffer并充分混合（對(duì)于多個(gè)反應(yīng)，建議將B Buffer加至反應(yīng)管的蓋子內(nèi)側(cè)，上下顛倒反應(yīng)管8-10次混勻）；

5).混勻后，將反應(yīng)液甩（或快速離心）至管子底部，然后立即將反應(yīng)管放入熒光檢測(cè)設(shè)備中。熒光檢測(cè)程序設(shè)置為：恒溫42 oC；每30 s采集一次FAM通道（信號(hào)采集通道的選擇與熒光探針設(shè)計(jì)一致）熒光值；反應(yīng)時(shí)間20 min。
注：如使用ABI系列PCR儀，請(qǐng)務(wù)必于passive reference和quencher處均選擇“none”。