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      KASP SNP基因分型技術(shù)介紹
      來(lái)源:Genenode|君諾德公司     發(fā)布時(shí)間:2017-12-26     Hits:19047


      單核苷酸多態(tài)性
      (Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指由于單個(gè)核苷酸堿基的改變而導(dǎo)致的核酸序列的多態(tài)性。在不同個(gè)體的同一條染色體或同一位點(diǎn)的核苷酸序列中,絕大多數(shù)核苷酸序列一致而只有一個(gè)堿基不同的現(xiàn)象,這就是SNP。
       由于SNP在人類基因組中數(shù)量較多,發(fā)生頻率較高,因此被認(rèn)為是繼微衛(wèi)星之后的新一代遺傳學(xué)標(biāo)記,在醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)、藥物遺傳學(xué)、疾病遺傳學(xué)、疾病診斷學(xué)、以及人類進(jìn)化等研究領(lǐng)域都有著很高的研究?jī)r(jià)值和應(yīng)用前景。


      KASP SNP技術(shù)原理
      KASP方法即Kompetitive Allele-Specific PCR(競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR),可以用2個(gè)熒光探針、2個(gè)通用淬滅探針,再加多個(gè)位點(diǎn)特異探針來(lái)檢則多個(gè)SNP位點(diǎn),這項(xiàng)技術(shù)是基于引物末端堿基的特異匹配來(lái)對(duì)SNP分型以及檢測(cè)InDels (插入和缺失)。原理上類似Taqman檢測(cè),也是基于終端熒光讀取判斷,每孔采用雙色熒光檢測(cè)一個(gè)樣本的一個(gè)位點(diǎn)可能的兩種基因型,而KASP技術(shù)與Taqman技術(shù)不同的是,它不需要每個(gè)SNP位點(diǎn)都去合成特異的熒光引物,它基于自己獨(dú)特的ARM PCR原理,讓所有的位點(diǎn)檢測(cè)最終都使用通用熒光引物擴(kuò)增,這大大降低了LGC KASP的試劑成本,既有金標(biāo)準(zhǔn)的準(zhǔn)確,又降低了使用成本,比Taqman還具有更好的位點(diǎn)適應(yīng)性,所以在醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)檢測(cè)方面KASP都有非常好的應(yīng)用,尤其適用于大量樣本,大量位點(diǎn)的檢測(cè),檢出率高,準(zhǔn)確性好。

      技術(shù)特點(diǎn):高通量,簡(jiǎn)單,靈活,準(zhǔn)確率高,檢出率好!
      分型結(jié)果準(zhǔn)確,準(zhǔn)確度>99.8%
       基于終端熒光讀取判斷,每孔采用雙色熒光檢測(cè)一個(gè)樣本的一個(gè)位點(diǎn)可能的兩種基因型,不同的SNP模板對(duì)應(yīng)不同的熒光產(chǎn)物。
       檢測(cè)成本低
       不需要每個(gè)SNP位點(diǎn)都去合成特異的熒光引物,它基于自己獨(dú)特的ARM PCR原理,讓所有的位點(diǎn)檢測(cè)最終都使用通用熒光引物擴(kuò)增,這大大降低了試劑成本。合成的探針可用于上千樣本的檢測(cè)。
       節(jié)省樣品
       對(duì)樣本質(zhì)量要求沒(méi)那么高,每個(gè)SNP檢測(cè)僅需樣本1-10ng DNA (根據(jù)人類基因組大小測(cè)算)。
       檢測(cè)時(shí)間短,檢測(cè)通量高
       全自動(dòng)的工作平臺(tái)及超大通量,使得實(shí)驗(yàn)最短的時(shí)間內(nèi)完成檢測(cè),,靈活采用 96 孔板、384 孔板,甚至是 1536 孔板,一天可檢測(cè)八萬(wàn)個(gè)以上 SNP 位點(diǎn);檢測(cè)體積低至 1μL,且僅采用常規(guī)引物探針即可完成實(shí)驗(yàn),大大降低檢測(cè)成本。
       一站式服務(wù)
       從提供生物樣本開(kāi)始,進(jìn)行探針設(shè)計(jì)、DNA抽提、檢測(cè)到分析結(jié)果,提供省心省力的一站式服務(wù)。

      成本最低,準(zhǔn)確率高,檢出率好的SNP分型方法:
       基因分型費(fèi)用2.5-3元/位點(diǎn),引物探針設(shè)計(jì)合成費(fèi)用:200-300元/位點(diǎn)。

      客戶需提供
      • 細(xì)胞,組織或血液等樣品材料,基因組DNA提取費(fèi)用單獨(dú)收費(fèi); 
      • 基因組DNA(體積≥30μl,濃度≥50 ng/μl),純度 OD260/280 為1.7~1.9之間; 
      • 人類基因組需提供SNP位點(diǎn)的RS號(hào)。其它物種如牛、雞、魚(yú)等無(wú)rs號(hào)的,需提供SNP位點(diǎn)上下游各200bp的確切序列,SNP位點(diǎn)的突變類型,以及位點(diǎn)的上下游25bp內(nèi)是否存在其它連鎖位點(diǎn)。
      最終提交結(jié)果
      • SNPs結(jié)果(ExceL表格); 
      • 2. 完整實(shí)驗(yàn)報(bào)告:擴(kuò)增和反應(yīng)體系、所涉及的引物、探針序列;


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       聯(lián)系方式:
       武漢君諾德生物技術(shù)有限公司
       北京君諾德生物技術(shù)有限公司
       電話:18518676727 張昌源
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